微孔过滤器可分为三类：深度、表面和筛网。深度过滤器是将纤维或材料压缩成基质，通过随机吸附或截留保留颗粒。表面过滤器由多层介质制成。当流体通过过滤器时，大于过滤器矩阵内空间的颗粒会保留下来，主要聚集在过滤器表面。筛网过滤器（也称为膜过滤器）是一种固有的均匀结构，它像筛网一样，保留所有比其表面精确控制的孔径大的颗粒。

过滤器之间的区别很重要，因为这三个过滤器的功能非常不同。深度过滤器通常用作预过滤器，因为它是去除≥98%悬浮固体并保护下游元件免受污染或堵塞的经济方法。它们的高容量是因为污染物被截留并保留在整个过滤深度内。表面过滤器去除99.99%的悬浮固体，可用作预过滤器或澄清过滤器。筛网（微孔膜）过滤器在保持大于其孔径的污染物方面100%有效。这些过滤器被放置在系统中最远的位置，以去除最后残留的树脂碎片、碳微粒、胶状颗粒和微生物。例如，保留所有细菌的0.22μm默克膜过滤器通常用于消毒静脉内溶液、血清和抗生素。

根据大小和/或形状区分的背景过滤器是众所周知的。例如，一种类型的过滤器提供了一条曲折的路径，粒子必须通过该路径才能通过过滤器这些过滤器有时被称为深度过滤器，通常使用由厚层纤维或其他材料制成的过滤器元件。由于它们的厚度和曲折的路径过滤技术，这些过滤器有时需要相对较高的跨膜，即传输，由于其厚度和曲折的路径过滤技术，压力以促进流经过滤器。与深度过滤器不同，另一种众所周知的过滤器采用相对较薄的滤膜，通常具有标称孔径。这种膜已广泛应用于各种医疗和工业应用。例如，这种标称孔径小于0.22微米的滤膜被用来过滤液体（如静脉注射溶液）中的细菌和其他物质。这种微孔过滤器也被用来分离人血液中的细胞成分（红细胞、白细胞和血小板）和悬浮在其中的液体血浆M。